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Plateforme de Bio-informatique


Plateforme de médecine computationnelle
pour la mise en valeur de la recherche et
des applications cliniques en génomique

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La Plateforme de bio-informatique est l’une des plateformes technologiques du Centre de biologie translationnelle (CBT) à l’Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill (IR-CUSM). L’objectif des professionnelles de la plateforme est d’accélérer la recherche en génomique et ses applications en milieu clinique afin de répondre aux besoins des équipes de recherche, des services de santé et de l’industrie émanant de la révolution génomique. Leur mission est de développer les compétences en bio-informatique et biologie computationnelle à IR-CUSM afin que les équipes de recherche, et ultimement les patients, bénéficient au maximum des analyses de données génomiques.





Applications and services


Analyses
bio-informatiques

Analyses bio-informatiques et traitement de données génomiques:

  • Analyses bio-informatiques pour le traitement de données de séquençage de nouvelle génération
  • Séquençage d’ADN
  • Génome
  • Exome
  • Séquençage ciblé
  • Séquençage d’ARN
  • Détection de variations structurales génomiques
  • Annotation personnalisée des variations
  • Assistance dans la conception de projets


Gestion de données

Support pour l’intégration et la gestion de données cliniques et de laboratoire:

  • Gestion de données avec LabKey
  • Logiciel simple d’utilisation, accessible par le web
  • Jeux de données orientés sur les patients
  • Contrôler, sécuriser et partager l’accès de données
  • Filtrer, exporter et créer des rapports sur les jeux de données



Afin d'en apprendre d'avantage sur LabKey, vous pouvez cliquer ici : Introduction sur LabKey
Implantation
d’outils génomiques

Accélérer la transition et l’implantation des outils de génomique pour le soin:

  • Automatisation de rapports cliniques par LabKey
  • Analyse et annotation de données génomiques pour le diagnostic moléculaire


Notre équipe


Daniel Jimenez

Gestionnaire de la plateforme


Cédric Roux

Bio-informaticien

Mathieu Simard

Gestionnaire de la plateforme SAIL
Bio-informaticienn

Aude Gerbaud

Bio-informaticienne

Accès à nos services


computer_dna

Les prix suivants sont donnés uniquement à titre informatifs.
Pour utiliser nos services ou obtenir un devis, n'hésitez pas à nous contacter.


Services/InstrumentsMembres de
l'IR-CUSM
McGillAcadémiqueIndustrie
Séquençage du génome entier (par échantillon)
Inclus rapports, CQs des variants et VNC
60$65$75$Merci de
nous contacter
Séquençage complet de l'exome (par échantillon)
Inclus rapports, CQs des variants et VNC
40$45$50$Merci de
nous contacter
Analyse d'expression différentielle de RNA-Seq Cas/Contrôle
Inclus CQs, tableaux & figures de l'analyse d'expression génique et des voies de signalisation
700$800$900$Merci de
nous contacter
Suppport bio-informatique (taux horaire)75$85$95$Merci de
nous contacter
Développement d'un système de gestion des données
Fonctionnalités de sécurité spécifiques à l'utilisateur, formulaires et rapports personnalisés, etc.
Merci de nous contacter

Nous contacter


phone

514-934-1934, ext. 76406

address

Site Glen, ES1.5500
Institut de recherche du Centre universitaire de santé McGill
1001 Bd Décarie, Montréal, QC H4A 3J1

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